Das Zentrum für Angewandte Proteomik (ZAP) positioniert sich an der Schnittstelle von akademischer Grundlagenforschung im Bereich der Proteinanalyse und der industriellen Verwertung und Weiterentwicklung in Pharmazie, Biologie, Chemie sowie angrenzenden Wissenschaften.

Das ZAP wurde 2006 als Teil der Lebenswissenschaftlichen Innovationsplattform Dortmund ins Leben gerufen. Das Projekt ermöglicht es den beteiligten Wissenschaftlern, neuartige Instrumente und Methoden zu entwickeln, um detailliertere und aussagekräftigere Analysen aller in einer Zelle exprimierten Proteine, ihrer Regulierung und der Netzwerke, mit denen sie in Wechselwirkung treten, treffen zu können. Durch exaktere Vorhersagen in der frühen, z. T. vorklinischen Medikamentenentwicklung können später z. B. die Risiken ungewollter Nebenwirkungen von zukünftigen Arzneimitteln reduziert werden oder die Spezifität genauer bestimmt werden.

Ziel des Zentrums ist die Verknüpfung und der schnelle Transfer der Forschungs- und Entwicklungsergebnisse dieser Zukunftstechnologien in kommerzielle Anwendungen. Damit wird die wesentliche Basis für die Entwicklung neuer Spitzentechnologien sowie neuer Produkte am Standort Dortmund geschaffen.